Il Marina di Nettuno é protetto da un molo di sopraflutto a quattro bracci e da un molo di sottoflutto. Dispone di 1000 posti barca da 6 a 40 metri di lunghezza. Le imbarcazioni in transito ormeggiano su un pontile dopo l’avamporto, a dritta, ed un pontile galleggiante sotto la torre di controllo. Orario di accesso: continuo. Accesso: contattare la torre di controllo vhf canale 09. Fari e fanali: 2253 (E 1541.2) - fanale a lampi verdi, periodo 5 sec., portata 7 M, sulla testata del molo frangiflutto; 2254 (E 1541.3) - fanale a lampi rossi, periodo 5 sec., portata 7 M, sulla testata del molo di sottoflutto; 2254.2 (E 1541.35) - fanale a luce fissa verde, 2 vert., portata 4 M, sull’estremità del pennello nell’Avamporto (oscurato da 295° a 355°); 2254.6 (E 1541.45) - fanale a luce fissa verde, portata 1 M, sulla testata dello sporgente della Capitaneria; 2254.4 (E 1541.4) - fanale a luce fissa rossa, portata 1 M, sulla testata del molo Bunkeraggio. Fondo marino: sabbioso. Fondali: in banchina 3 m. Radio: torre di controllo Vhf canale 09 (servizio continuo). Posti barca: 1000 di cui 100 riservati al transito. Lunghezza massima: 40 m. Venti: libeccio e scirocco. Traversia: sud-est, sud-ovest. Rade sicure più vicine: porto di Anzio.
Le imbarcazioni in transito ormeggiano su un pontile galleggiante posto davanti la torre di controllo; la direzione del porto gestisce i posti pubblici in transito. Ogni posto barca è privato: le agenzie nautiche presenti nel porto gestiscono i posti che i soci mettono a loro disposizione. Il Comune di Nettuno gestisce le banchine “P”-“Q”.