Il porto rifugio di Pignataro è costituito da un molo foraneo (lungo 275 m e orientato per SW) banchinato e munito di bitte e anelli da ormeggio e da una banchina di riva. La parte finale del molo è riservata alle navi traghetto.
Orario di accesso: continuo.
Fari e fanali: 3292 (E 1788) - fanale a lampi verdi, periodo 3 sec., portata 8 M, sulla testata del molo di Pignataro.
Fondo marino: fangoso, sabbioso.
Fondali: in banchina da 3 a 5 m.
Radio: Vhf canale 74 Porto Pignataro srl.;  Vhf canale 07 Giovinazzo Servizi Nautici; Vhf canale 09 Eol.Mare srl.
Divieti: di ormeggio nel tratto di banchina di Pignataro a partire dalla radice del molo per una lunghezza di 30 m, al fine di consentire le manovre di ingresso/uscita dei mezzi navali militari e di polizia.
Posti barca: 255.
Lunghezza massima: 35 m.
Venti: scirocco, greco-tramontana.
Traversia: scirocco.
Ridosso: dai venti del I e II quadrante.
Rade sicure più vicine: a metà circa del versante meridionale della Sciara di Monterosa, poco ad Est del vallone che divide il monte dall’altura successiva (m 228), a circa 180 m da terra (fondo marino sabbioso da 30/40 m).